首次申辦2000版往來港澳通行證，國家機關副處級以上人員（增城、從化為副科級以上）、國有大中型企業中層以上領導人員及下屬企業領導班子成員、區（縣）級國有企業領導班子成員、國有控股參股企業中的國有股權代表、縣級以上金融、保險、證券系統中層以上領導人員、廳局級以上離退休幹部等須提交單位意見。

已持有效2000版往來港澳通行證再次申請簽注的，所有人員無須提交單位意見。