實行個人港澳游後，原團隊旅遊的申請辦法不變。申請人既可以選擇以個人港澳遊方式申請出境，也可以選擇以團隊旅遊方式申請出境。不同之處：
　　一是申請時提交的資料不同，團隊旅遊須先向旅行社報名，在申請時提交旅遊發票，個人港澳游不需要。

　　二是出境方式不同，團隊旅遊須由旅行社組團出境，個人港澳游可以自行出境。

　　三是在港澳停留時間不同，團隊旅遊在香港可停留14天，在澳門停留7天，個人港澳游在香港只能停留7天。

　　四是簽發的簽注不同，團隊旅遊為「L」簽注，個人港澳游為「F」簽注。